54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1333 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  43.15 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  40.91 
 
 
253 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  41.86 
 
 
249 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  40.42 
 
 
243 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  40.48 
 
 
253 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  40.24 
 
 
253 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  41.6 
 
 
251 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  40.32 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  40.91 
 
 
247 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  39.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  39.3 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  39.26 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  35.96 
 
 
244 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  36.33 
 
 
252 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  44.26 
 
 
257 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  39.17 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  35.37 
 
 
244 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  32.54 
 
 
245 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  36.36 
 
 
275 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  37.87 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  38.98 
 
 
259 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  31.78 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  37.14 
 
 
261 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  41.91 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  34.76 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  35.51 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  35.44 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  31.63 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  35.83 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  36.64 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  33.63 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  31.14 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  36.42 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  33.68 
 
 
318 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2826  hypothetical protein  32.98 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473489  normal  0.673375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0177  hypothetical protein  28.92 
 
 
195 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.23071  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1327  hypothetical protein  36.04 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3996  hypothetical protein  34.72 
 
 
195 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  31.38 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  34.72 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4263  hypothetical protein  32.57 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444391  normal  0.375648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.1 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  33.73 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  30.66 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  29.59 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  36.67 
 
 
122 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  29.81 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  33.56 
 
 
314 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  25.78 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2348  hypothetical protein  35.79 
 
 
197 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>