210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0279 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 300 aa  614  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  68.2 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  62.54 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 		 295 aa  358  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  60.93 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  60.82 
 
 		 299 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 		 304 aa  354  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  59.39 
 
 		 315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  57.72 
 
 		 307 aa  348  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  58.86 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  58.19 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  60.9 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  58.82 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  57.19 
 
 		 304 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  57.43 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  59.45 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  56.54 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  56.21 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  57.1 
 
 		 303 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  58.63 
 
 		 303 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  56.03 
 
 		 304 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  59.52 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  59.11 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  54.01 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  57.24 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  53.42 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  54.01 
 
 		 306 aa  301  8.000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  50.84 
 
 		 303 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  54.73 
 
 		 291 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  53.38 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 		 298 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  54.05 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  55.89 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  58.36 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  54.39 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  53.57 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  52.56 
 
 		 286 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  50.85 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 		 284 aa  265  1e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  44.41 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  41.41 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  42.09 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  41.08 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  42.19 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  42.18 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  44.41 
 
 		 348 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  44.52 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 347 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  42.62 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  41.27 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  40.06 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  44.8 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  43.97 
 
 		 327 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  41.87 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  45.49 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  42.65 
 
 		 454 aa  209  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  42.61 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  42.81 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  43.97 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  43.62 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  44.29 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  43.26 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  42.51 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.6 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>