More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3545 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  52.59 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  45.79 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  41.57 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  47.25 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  44.87 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.71 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  45.24 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  42.17 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  43.06 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  52.7 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  39.05 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  40.19 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.86 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  33.93 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 193 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 		 263 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  33.01 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.97 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>