More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1844 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1844  response regulator receiver  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.93 
 
 		 230 aa  301  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  61.88 
 
 		 222 aa  254  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 223 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  61.43 
 
 		 222 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.57 
 
 		 223 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  59.64 
 
 		 222 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.47 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.74 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.15 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.73 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05980  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  62.88 
 
 		 230 aa  235  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.553702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.19 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.85 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.06 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.52 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.86 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.74 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.72 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  41.38 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  43.86 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  40.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  41.99 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.36 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.36 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  44.98 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.41 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 242 aa  167  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 243 aa  167  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  46.19 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.96 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  43.48 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  44.93 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 240 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  39.39 
 
 		 245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.79 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>