79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1825 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  100 
 
 		 177 aa  353  5.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  58.6 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  41.1 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  52.17 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  41.1 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  49.66 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  40.49 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  40.49 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  39.88 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  40.96 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  41.98 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  41.51 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  38.75 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  38.36 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  38.65 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  38.01 
 
 		 516 aa  97.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  38.04 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  31.52 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  38.27 
 
 		 825 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  43.42 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  40.97 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  38.61 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  36.42 
 
 		 520 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  37.04 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  36.14 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  32.91 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  34.81 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  33.83 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  33.95 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  36.88 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.88 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  38.14 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  29.63 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  35.71 
 
 		 478 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  36.67 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  39.29 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  28.81 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  32.98 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  31.01 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  32.67 
 
 		 471 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  37.93 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  31.96 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  31.96 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  31.96 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.81 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  30.21 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  30.93 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4490  hypothetical protein  30.97 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.910632  normal  0.397544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  30.61 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.43 
 
 		 592 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  30.21 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  25.32 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  30.21 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  31.94 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  38.27 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  30.41 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  29.9 
 
 		 171 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  29.8 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  28.93 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  32.14 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06190  hypothetical protein  38.03 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  28.19 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1150  hypothetical protein  35.61 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.738978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  25.61 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  36.76 
 
 		 482 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  34.48 
 
 		 475 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  25.99 
 
 		 633 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.58 
 
 		 589 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>