251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0249 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  49.12 
 
 
242 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  44.2 
 
 
247 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  45.89 
 
 
242 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 
242 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 
242 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 
246 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  39.48 
 
 
272 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 
258 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.08 
 
 
278 aa  88.6  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.09 
 
 
269 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
321 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  26.24 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  30.59 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
221 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  21.95 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  22.93 
 
 
228 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
306 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
321 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  48.15 
 
 
290 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  23.84 
 
 
285 aa  55.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
314 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  23.36 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  24.22 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  31.98 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  30.34 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  35.9 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
336 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  22.69 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0848  Beta-lactamase-like  32.47 
 
 
255 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.701692  hitchhiker  0.00132369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.63 
 
 
321 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
322 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  23.11 
 
 
217 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  22.77 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  21.95 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  22.94 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  23.11 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  23.11 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  26.54 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  23.11 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.72 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  30.51 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  26.54 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  23.11 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  25.31 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  22.62 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  25.75 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
327 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
329 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
273 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.04 
 
 
297 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
282 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  23.08 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  22.48 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  30.54 
 
 
281 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
281 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  21.29 
 
 
228 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
497 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
286 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 
259 aa  48.5  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2191  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
497 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  22.44 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  20.3 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  36.76 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  36.76 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  29.34 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>