More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0179 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  100 
 
 
140 aa  275  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  66.67 
 
 
125 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  63.64 
 
 
130 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  62.39 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  55.73 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  51.91 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  57.98 
 
 
136 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  58.1 
 
 
128 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  50.41 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  57.01 
 
 
149 aa  119  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  52.59 
 
 
178 aa  119  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  52.59 
 
 
178 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  58.04 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  56.88 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  59.8 
 
 
132 aa  117  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  55.37 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  43.75 
 
 
170 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  57.26 
 
 
167 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  52.73 
 
 
122 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  45.38 
 
 
174 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  44.44 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  51.35 
 
 
187 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  53.27 
 
 
187 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  45.6 
 
 
171 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  47.06 
 
 
194 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  47.69 
 
 
176 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  43.07 
 
 
181 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  46.22 
 
 
195 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  45.3 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  48.65 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  44.54 
 
 
200 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  45.61 
 
 
174 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  40.65 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  45.61 
 
 
174 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  40.65 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  39.02 
 
 
156 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  42.11 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  41.6 
 
 
162 aa  90.9  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  44.63 
 
 
172 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  43.86 
 
 
174 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  44.54 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  43.1 
 
 
174 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  37.6 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  39.09 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  43.86 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  39.13 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  38.53 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  42.74 
 
 
197 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  37.39 
 
 
187 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  33.81 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  41.23 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  33.09 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  37.61 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  33.09 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  44 
 
 
222 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  35.11 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  35.11 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  34.21 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  34.4 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  32.71 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  36.36 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  35.96 
 
 
891 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  32.32 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  32.71 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  38.61 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  35.96 
 
 
483 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  35.65 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  42.53 
 
 
395 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  40 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  39.32 
 
 
219 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  43.01 
 
 
756 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.56 
 
 
1402 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  45.24 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
290 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.89 
 
 
203 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  35.64 
 
 
222 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.89 
 
 
203 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.89 
 
 
203 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  32.29 
 
 
289 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  39.77 
 
 
544 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  33.02 
 
 
541 aa  58.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
255 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  42.22 
 
 
1097 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36 
 
 
329 aa  58.2  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
249 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
255 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2058  hypothetical protein  36.36 
 
 
580 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.71 
 
 
382 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  32.29 
 
 
290 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  39.58 
 
 
220 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  32.29 
 
 
277 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  43.84 
 
 
811 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  38.67 
 
 
1585 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0237  ankyrin repeat-containing protein  40.7 
 
 
349 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00752585  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  44.12 
 
 
855 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  40.45 
 
 
442 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2048  hypothetical protein  36.36 
 
 
581 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36555  predicted protein  38.2 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  38.36 
 
 
278 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>