38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3938 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  100 
 
 		 165 aa  339  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  98.79 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  70.3 
 
 		 165 aa  244  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  65.45 
 
 		 165 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  63.03 
 
 		 165 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  57.58 
 
 		 165 aa  198  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  43.64 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2440  Rubrerythrin  40.88 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  42.14 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  39.87 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  39.24 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1058  rubrerythrin  38.36 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2744  hypothetical protein  35.62 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.601156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2925  hypothetical protein  28.28 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1300  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000609616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  29.93 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0250  hypothetical protein  28.19 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3242  rubrerythrin  27.52 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  hitchhiker  0.000706309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0416  rubrerythrin  26.76 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  28.86 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  27.89 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0458  Rubrerythrin  25.83 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  28.87 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  25.32 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3293  hypothetical protein  23.84 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0508681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0104  rubrerythrin  27.86 
 
 		 139 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  27.78 
 
 		 1008 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  23.38 
 
 		 280 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  25.33 
 
 		 152 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  24.69 
 
 		 171 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.39 
 
 		 1011 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  41.18 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1085  hypothetical protein  28.93 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1783  hypothetical protein  26.28 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.127386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  27.52 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  26.67 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.39 
 
 		 1011 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>