223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3347 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3347  Organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 684 aa  1389    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0898  Organic solvent tolerance protein  93.71 
 
 		 684 aa  1320    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33463e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3276  organic solvent tolerance protein  50.98 
 
 		 710 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2474  organic solvent tolerance protein, putative  43.7 
 
 		 697 aa  582  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2367  organic solvent tolerance protein, putative  46.37 
 
 		 628 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  37.37 
 
 		 705 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1159  organic solvent tolerance protein  36.16 
 
 		 686 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0739  organic solvent tolerance protein OstA  34.24 
 
 		 701 aa  357  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.71512e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3208  organic solvent tolerance protein  26.91 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1088  Organic solvent tolerance protein  25.54 
 
 		 784 aa  194  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.567172  normal  0.030432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1670  organic solvent tolerance protein  24.77 
 
 		 756 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  25.18 
 
 		 762 aa  181  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1348  Organic solvent tolerance protein  25.62 
 
 		 781 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0268  Organic solvent tolerance protein  23.55 
 
 		 765 aa  168  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1413  organic solvent tolerance protein, putative  25.12 
 
 		 777 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000119943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 		 753 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  23.67 
 
 		 774 aa  150  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  25.16 
 
 		 929 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  22.84 
 
 		 727 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  22.84 
 
 		 701 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  22.73 
 
 		 773 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  24.81 
 
 		 810 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  22.88 
 
 		 765 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  22.77 
 
 		 765 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  22.87 
 
 		 765 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  24.39 
 
 		 778 aa  138  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  23.88 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  23.88 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  23.63 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 		 757 aa  136  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  21.35 
 
 		 766 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  23.02 
 
 		 765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2032  organic solvent tolerance protein  23.94 
 
 		 778 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  25.99 
 
 		 813 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  22.49 
 
 		 774 aa  133  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  25.36 
 
 		 738 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  25.64 
 
 		 751 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  24.9 
 
 		 773 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  21.84 
 
 		 766 aa  132  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  24.92 
 
 		 813 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  23.77 
 
 		 824 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  22.22 
 
 		 765 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  25.71 
 
 		 836 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  25.39 
 
 		 811 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  21.05 
 
 		 790 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  23.26 
 
 		 728 aa  120  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  27.09 
 
 		 860 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  24.46 
 
 		 813 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  24.16 
 
 		 784 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  21.21 
 
 		 771 aa  117  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0058  Organic solvent tolerance protein  24.02 
 
 		 671 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  23.3 
 
 		 764 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  24.12 
 
 		 821 aa  114  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  26.31 
 
 		 826 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  22.7 
 
 		 803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  23.64 
 
 		 794 aa  111  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  25.73 
 
 		 1091 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  22.69 
 
 		 786 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  22.12 
 
 		 786 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  22.65 
 
 		 856 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  22.53 
 
 		 786 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  24.54 
 
 		 814 aa  108  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  25.76 
 
 		 822 aa  107  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  22.83 
 
 		 781 aa  107  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0599  Organic solvent tolerance protein  21.88 
 
 		 710 aa  107  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.784934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  24.66 
 
 		 750 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  27 
 
 		 791 aa  107  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0160  organic solvent tolerance protein OstA-like  30.9 
 
 		 832 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  31.96 
 
 		 819 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 		 735 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0235  putative periplasmic protein  24.1 
 
 		 744 aa  105  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.919677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 		 786 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 		 786 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  21.85 
 
 		 786 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  27.7 
 
 		 799 aa  104  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 		 938 aa  104  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  27.44 
 
 		 783 aa  104  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  25.05 
 
 		 922 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  21.21 
 
 		 789 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  25.2 
 
 		 792 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  21.11 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  22.43 
 
 		 787 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 		 932 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  28.28 
 
 		 792 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  24.49 
 
 		 937 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.65 
 
 		 935 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  29.65 
 
 		 863 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001662  Imp required for envelope biogenesis/organic solvent tolerance protein precursor  27.34 
 
 		 781 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.27 
 
 		 934 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  21.46 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  21.46 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  26.69 
 
 		 774 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  21.46 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  21.46 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  21.46 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  21.46 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  21.46 
 
 		 761 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  24.2 
 
 		 924 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  26.34 
 
 		 926 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>