76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1775 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  100 
 
 		 344 aa  712    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  94.19 
 
 		 344 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  64.55 
 
 		 344 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  59.39 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  55.76 
 
 		 342 aa  381  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  52.12 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  50.6 
 
 		 348 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  41.59 
 
 		 471 aa  265  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  39.94 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.14 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  35.76 
 
 		 344 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  32.33 
 
 		 361 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  34.51 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  36.9 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  35.01 
 
 		 350 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  34.78 
 
 		 346 aa  202  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  34.12 
 
 		 354 aa  202  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  31.96 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  33.43 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  31.87 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  34.72 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  32.86 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  34.5 
 
 		 357 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  31.53 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  32.12 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  31.39 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  26.8 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  29.84 
 
 		 369 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  27.92 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.19 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  24.64 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.26 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.65 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  20.9 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  24.12 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  21.98 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  24.2 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  26.92 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  26.24 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.08 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  20.75 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.31 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.99 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  23.35 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28.74 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  24.07 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  22.97 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  21.5 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.87 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  25.84 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.9 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  22.98 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.97 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  22.98 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  21.33 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  21.9 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  26.75 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  18.72 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2852  hypothetical protein  25.77 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000023268 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  25.15 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  20.98 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  29.59 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  20.98 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  22.81 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  31.02 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  19.63 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  24.5 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  21.51 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  22.22 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  27.52 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  23.28 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  28.92 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  23.56 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.6 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  26.47 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>