More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1021 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  100 
 
 		 309 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  97.73 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  75.5 
 
 		 302 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  64.55 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  61.33 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  60.27 
 
 		 300 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  59.53 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  59.6 
 
 		 302 aa  338  8e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  53.04 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  54.33 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  54.43 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  53.69 
 
 		 290 aa  320  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  53.62 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  51.99 
 
 		 283 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  54.93 
 
 		 303 aa  308  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  53.18 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  53.38 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  50.84 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  51.84 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  52.63 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  47.02 
 
 		 289 aa  269  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  46.18 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  46.08 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  47.18 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  46.36 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  46.84 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  47.65 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  42.71 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  42.47 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  41 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  43.34 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  43.04 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  42.09 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  44.48 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  42.76 
 
 		 280 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  41.47 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  42.23 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  41.14 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  40.88 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  37.71 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  41.84 
 
 		 283 aa  225  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  40.2 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.22 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  38.78 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  40.8 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  40.92 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  38.26 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  40.92 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  39.8 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  39.4 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.26 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  37.67 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  38.13 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  41.14 
 
 		 283 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  39.47 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.33 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  40.43 
 
 		 277 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  40.85 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  39.46 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  38.64 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  39.53 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  39.19 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  38.94 
 
 		 285 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  37.58 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  37.38 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  37.87 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  36.96 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  38.13 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  38.33 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  37.62 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  37.12 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  36.7 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  36.7 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  36.7 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  37.21 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  36.7 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  37 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  36.7 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  36.7 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  38.8 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  36.33 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  37 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  37 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  34.44 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  36.7 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  36.68 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  31.89 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  36.91 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  36 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  32.89 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  33 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  35.53 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  32.23 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  34.78 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  33.67 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  31.88 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  31.56 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  37.42 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  30.26 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  36.7 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>