More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2041 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 567 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 567 aa  705    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  73.07 
 
 		 566 aa  875    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  73.07 
 
 		 566 aa  875    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  73.07 
 
 		 566 aa  875    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  72.89 
 
 		 566 aa  875    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  73.61 
 
 		 566 aa  884    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  72.71 
 
 		 566 aa  875    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  73.07 
 
 		 566 aa  875    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 567 aa  1170    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 573 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  73.07 
 
 		 566 aa  875    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  72.71 
 
 		 566 aa  871    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  87.1 
 
 		 567 aa  1052    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0693  prolyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 577 aa  659    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0657028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  73.07 
 
 		 566 aa  875    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 567 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  72.71 
 
 		 566 aa  872    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 569 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 568 aa  634  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 566 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 574 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 571 aa  625  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 576 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2432  prolyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 616 aa  624  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0688  prolyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 574 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 568 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 574 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 580 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 570 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 576 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 571 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 570 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 585 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 573 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 570 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 570 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 571 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0982  prolyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00893244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 579 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 580 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 570 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 570 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 577 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 577 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 571 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0247  prolyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 571 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 571 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 583 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 573 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 571 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3504  prolyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 572 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 573 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 572 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 572 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  54.24 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 571 aa  598  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 578 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 572 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 572 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 580 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1913  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 617 aa  597  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 578 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  53.33 
 
 		 575 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 573 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3347  prolyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 572 aa  598  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0134098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 578 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 577 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>