More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1537 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1537  ABC transporter related protein  100 
 
 
241 aa  500  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  35.74 
 
 
338 aa  148  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  41.18 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.71 
 
 
251 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
307 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
318 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.02 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  35.9 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  40.62 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  35.35 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  36.73 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
371 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
368 aa  138  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.02 
 
 
247 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  39.7 
 
 
334 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.29 
 
 
334 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.41 
 
 
350 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  39 
 
 
303 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  36.67 
 
 
328 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
262 aa  134  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  30.61 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.68 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.48 
 
 
305 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  38.24 
 
 
245 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  38.42 
 
 
325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  30.2 
 
 
243 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.51 
 
 
321 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.78 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.78 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.78 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.92 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  31.56 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0987  ABC transporter-like protein  33.91 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.488285  normal  0.723293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.92 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  33.93 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  37.44 
 
 
356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.41 
 
 
322 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  34 
 
 
242 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  36.64 
 
 
299 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  30.6 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  33.05 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  34.73 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  35.35 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  35.56 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 
318 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  37.24 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  32.94 
 
 
306 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  34.31 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.65 
 
 
320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  38.53 
 
 
291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  36.28 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.89 
 
 
319 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.58 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.72 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.81 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  34.31 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  34.2 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  32.74 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  34.86 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  39.2 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  34.56 
 
 
334 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  33.47 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
306 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  33.63 
 
 
321 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  34.08 
 
 
340 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  33.77 
 
 
337 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  30.91 
 
 
328 aa  125  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  31.98 
 
 
256 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.88 
 
 
343 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
248 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0406  ABC transporter related  33.18 
 
 
231 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.18 
 
 
325 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
306 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  36.2 
 
 
309 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  29.65 
 
 
241 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  33.61 
 
 
244 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.27 
 
 
323 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1499  ABC transporter related  33.18 
 
 
238 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  36.04 
 
 
289 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
312 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  36.27 
 
 
237 aa  123  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1411  ABC-type transport system, ATPase component  30.28 
 
 
317 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715833  unclonable  3.14e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.61 
 
 
250 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  35.96 
 
 
252 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1454  ABC transporter related  33.04 
 
 
238 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  33.78 
 
 
317 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
240 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  32.9 
 
 
241 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  32.07 
 
 
252 aa  123  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  32.2 
 
 
316 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  30.93 
 
 
241 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  34.1 
 
 
338 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.76 
 
 
332 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.92 
 
 
334 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.22 
 
 
326 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>