More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0406 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0406  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1499  ABC transporter related  52.29 
 
 
238 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1454  ABC transporter related  52.29 
 
 
238 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  40.18 
 
 
334 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  41.24 
 
 
317 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.88 
 
 
323 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  38.29 
 
 
309 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  34.53 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  32.23 
 
 
241 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  32.42 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  34.36 
 
 
305 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.63 
 
 
243 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  34.3 
 
 
296 aa  135  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  32.23 
 
 
301 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.33 
 
 
303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  34.9 
 
 
340 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
273 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  34.9 
 
 
334 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
368 aa  132  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
351 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
334 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
351 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 
334 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  36.79 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
306 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.75 
 
 
321 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0903  ABC transporter related  35.32 
 
 
303 aa  129  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  37.16 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0997  ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 
305 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  30.84 
 
 
373 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  30.84 
 
 
326 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  32.09 
 
 
328 aa  128  9.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  29.66 
 
 
323 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  36.53 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  33.68 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  30.84 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  34 
 
 
332 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0228  ABC transporter related  32.55 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00487637  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.84 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  31.78 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.6 
 
 
326 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  31.78 
 
 
345 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 
312 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  31.31 
 
 
304 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  29.86 
 
 
319 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  32.74 
 
 
578 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  30.84 
 
 
344 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  31.72 
 
 
252 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  34.72 
 
 
320 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3971  ABC transporter related  33.96 
 
 
306 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1537  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
241 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  30.94 
 
 
337 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  32.88 
 
 
338 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0377  ABC transporter related  34.47 
 
 
309 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  32.7 
 
 
331 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  30.97 
 
 
350 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.66 
 
 
323 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.08 
 
 
446 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.04 
 
 
313 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.73 
 
 
334 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.51 
 
 
298 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.5 
 
 
292 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
262 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  27.71 
 
 
312 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.6 
 
 
338 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  31.16 
 
 
337 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 
359 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2666  ABC transporter related  32.74 
 
 
342 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.73 
 
 
321 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.27 
 
 
334 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  31.43 
 
 
274 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.82 
 
 
366 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.95 
 
 
311 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.82 
 
 
366 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.82 
 
 
366 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.67 
 
 
324 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.12 
 
 
325 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  30.53 
 
 
313 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  33.49 
 
 
249 aa  121  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  31.6 
 
 
304 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  28.37 
 
 
321 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  33.33 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  32.24 
 
 
309 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  31.75 
 
 
575 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  33.33 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.32 
 
 
335 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  30.73 
 
 
295 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  32.85 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  36.79 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>