143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2997 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  100 
 
 		 362 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  76.96 
 
 		 369 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  63.51 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  60.94 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  60.66 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  50.65 
 
 		 392 aa  329  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  43.82 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  43.24 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  44.12 
 
 		 363 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  44.12 
 
 		 363 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  44.12 
 
 		 364 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  44.12 
 
 		 364 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  44.12 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  43.82 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  44.12 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.88 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  41.95 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  45.71 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  44.31 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.52 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  43.39 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  43.52 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  41.38 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  43.23 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  43.23 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  41.83 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  42.19 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  41.76 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  43.14 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  42.86 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  40.59 
 
 		 364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  40.59 
 
 		 364 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  41.18 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  44.27 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  47.15 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.45 
 
 		 576 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  44.51 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  43.32 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  40.45 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  46.22 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  40.78 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  44.76 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  41.59 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44.61 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  40.45 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  43.52 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.5 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  40.27 
 
 		 373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  47.01 
 
 		 364 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  45.88 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  41.74 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  45.43 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  43.84 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  43.84 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  39.41 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  44.18 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  42.69 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  40.62 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  34.61 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  42.47 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.79 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  41.49 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  41.84 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  44.55 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  41.6 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  43.84 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.4 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  44.59 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3651  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.61 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  44.27 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  39.72 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  42.36 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.44 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  32.49 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.41 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  39.06 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  33.24 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  45.49 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  40.58 
 
 		 393 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.87 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  36.16 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.13 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.68 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.3 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  38.48 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5729  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.53 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1374  cobalamin biosynthesis protein CbiD  34.72 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  37.76 
 
 		 489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  34.53 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  34.23 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.46 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0518  cobalt-precorrin-6A synthase  31.56 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  36.24 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  34.69 
 
 		 602 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1470  cobalt-precorrin-6A synthase  35.24 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0387  cobalt-precorrin-6A synthase  35.24 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.816983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0475  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.72 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0930  cobalamin biosynthesis protein CbiD  31.55 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  35 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.07 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>