61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2912 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  39.77 
 
 		 1053 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  46.31 
 
 		 1017 aa  846    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  48.87 
 
 		 1038 aa  894    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  40.58 
 
 		 1017 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  40.27 
 
 		 1018 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  100 
 
 		 1046 aa  2149    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  66.76 
 
 		 1036 aa  1436    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  42.76 
 
 		 1611 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  33.96 
 
 		 1009 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  34.34 
 
 		 902 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  33.04 
 
 		 958 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  32.91 
 
 		 958 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  33.62 
 
 		 955 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  33.58 
 
 		 957 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  41.81 
 
 		 1294 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  37.44 
 
 		 1106 aa  239  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1110 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  30.85 
 
 		 1143 aa  225  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  31.32 
 
 		 1143 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  28.07 
 
 		 1457 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  28.24 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  39.71 
 
 		 1281 aa  98.2  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  30.53 
 
 		 688 aa  93.2  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  29.69 
 
 		 2222 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  23.4 
 
 		 1672 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  29.29 
 
 		 1596 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  26.44 
 
 		 2499 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  28.62 
 
 		 1127 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  26.3 
 
 		 1691 aa  67.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  23.39 
 
 		 1196 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  26.72 
 
 		 2026 aa  65.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 1329 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  23.44 
 
 		 1438 aa  61.6  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 1329 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  25.85 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.54 
 
 		 2081 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  24.49 
 
 		 1496 aa  58.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  25.38 
 
 		 1916 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  25.47 
 
 		 672 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 1454 aa  55.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  23.74 
 
 		 1453 aa  54.7  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  30.39 
 
 		 1645 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  24.54 
 
 		 1848 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  28 
 
 		 1538 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  23.81 
 
 		 1525 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 1379 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  25.09 
 
 		 1521 aa  52.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  29.19 
 
 		 979 aa  51.2  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  23.67 
 
 		 1276 aa  51.2  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.79 
 
 		 2912 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.93 
 
 		 2803 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  32.2 
 
 		 1330 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  27.27 
 
 		 869 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  21.95 
 
 		 650 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25.63 
 
 		 939 aa  48.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1537 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  21.42 
 
 		 650 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  24 
 
 		 501 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.56 
 
 		 487 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  22.62 
 
 		 658 aa  44.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  24.77 
 
 		 358 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>