79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2320 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2320  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.357396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0134  hypothetical protein  72.12 
 
 		 203 aa  235  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0354  hypothetical protein  44.75 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0538989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1384  hypothetical protein  52.03 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.196429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1925  hypothetical protein  46.01 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1840  hypothetical protein  46.01 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.227725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2038  hypothetical protein  46.01 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1895  hypothetical protein  33.74 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3655  putative lipoprotein transmembrane  35.15 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2412  putative lipoprotein transmembrane  34.57 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0522  hypothetical protein  37.7 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.100924  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1178  putative lipoprotein transmembrane  33.73 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.740689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0441  putative lipoprotein transmembrane  36.31 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1131  putative lipoprotein transmembrane  37.13 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2818  putative lipoprotein transmembrane  34.04 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.450719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0355  putative lipoprotein transmembrane  31.52 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0365  putative lipoprotein transmembrane  31.52 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0748  putative lipoprotein transmembrane  30.23 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1552  putative lipoprotein transmembrane  30.99 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000152718  hitchhiker  0.00625373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4459  putative lipoprotein transmembrane  32.95 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0572  putative lipoprotein transmembrane  30.85 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1260  putative lipoprotein transmembrane  35.33 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1191  putative lipoprotein transmembrane  35.33 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.240649  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2542  putative lipoprotein transmembrane  32.54 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3608  putative lipoprotein transmembrane  32.16 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0068  putative lipoprotein transmembrane  31.55 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0580  hypothetical protein  29.67 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0931  hypothetical protein  29.66 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0456  hypothetical protein  31.67 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2072  putative lipoprotein transmembrane  27.33 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2970  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.704952  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08431  hypothetical protein  29.59 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.225751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1393  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.811496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3128  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1227  hypothetical protein  32.69 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1319  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1249  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2984  hypothetical protein  27.49 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2531  Chalcone isomerase, subgroup  26.32 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.598454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2632  hypothetical protein  27.49 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1299  hypothetical protein  28.81 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0971486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3275  hypothetical protein  27.98 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1327  hypothetical protein  25.56 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.829375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2514  hypothetical protein  29.51 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3109  hypothetical protein  29.89 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2394  hypothetical protein  28.97 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0591  hypothetical protein  26.23 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0309027  hitchhiker  0.0001229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2967  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2325  hypothetical protein  28.68 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1604  hypothetical protein  29.91 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3025  hypothetical protein  34.23 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0465  hypothetical protein  32.38 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1573  hypothetical protein  26.4 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3178  hypothetical protein  41.54 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1452  hypothetical protein  29.05 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1281  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1316  hypothetical protein  26.61 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397637  normal  0.139613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2339  hypothetical protein  45 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3061  hypothetical protein  26.61 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3204  hypothetical protein  26.61 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2707  hypothetical protein  28.44 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153182  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6580  hypothetical protein  34.51 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3102  hypothetical protein  28.79 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0655  hypothetical protein  24.35 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00474933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2070  hypothetical protein  29.67 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3047  hypothetical protein  25.69 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  40 
 
 		 431 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5831  hypothetical protein  31.53 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3430  hypothetical protein  30.89 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1173  hypothetical protein  25.45 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5883  hypothetical protein  28.77 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173352  normal  0.244977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1243  hypothetical protein  25.45 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.758941  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1048  hypothetical protein  35.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.419556  normal  0.928595 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0870  hypothetical protein  24.09 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1315  hypothetical protein  24.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1155  hypothetical protein  23.16 
 
 		 186 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3366  hypothetical protein  28.38 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1198  Chalcone isomerase  28.27 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>