80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1796 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  100 
 
 		 366 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  67.82 
 
 		 360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  61.24 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  63.86 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  60.96 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  49.7 
 
 		 349 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  37.92 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  37.92 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  37.92 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  37.95 
 
 		 375 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  33.93 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  32.6 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  31.69 
 
 		 498 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  33.03 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  33.43 
 
 		 423 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  32.34 
 
 		 478 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  32.81 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  30.4 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  31.88 
 
 		 547 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  32.72 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  31.13 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 489 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 		 486 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  32.42 
 
 		 474 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  30.06 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  29.43 
 
 		 487 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  33.45 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  33.01 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  29.62 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 		 483 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  30.62 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  31.74 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  29.17 
 
 		 346 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  28.17 
 
 		 485 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  27.95 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  29.75 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  28.62 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  28.67 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  30.04 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  28.04 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  31.34 
 
 		 484 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  28.47 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  27.87 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  28.47 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  30.24 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  27.49 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  26.4 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  25.32 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  25.32 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  25.9 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  26.57 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  25.64 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  24.92 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  26.74 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  24.7 
 
 		 667 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.07 
 
 		 877 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  23.62 
 
 		 896 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 		 873 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  23.57 
 
 		 863 aa  49.7  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  27.27 
 
 		 880 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  26.42 
 
 		 880 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  24.1 
 
 		 863 aa  46.2  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  23.9 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  22.47 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  27.39 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  29.17 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  22.53 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  24.13 
 
 		 874 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  23.68 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  22.73 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  22.8 
 
 		 898 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  23.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  28.66 
 
 		 872 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  23.87 
 
 		 888 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  22.7 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  23.42 
 
 		 667 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>