222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0227 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0227  type II DNA modification methyltransferase, putative  100 
 
 
305 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0255  C-5 cytosine-specific DNA methylase  72.24 
 
 
331 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.111291 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16674  predicted protein  27.6 
 
 
376 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87597  predicted protein  28.07 
 
 
371 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16070  predicted protein  31.22 
 
 
398 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171714  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.51 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
338 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.61 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  24.84 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  21.54 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  22.95 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  34.42 
 
 
424 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  24.02 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
419 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 
414 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  21.5 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 
468 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.81 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.47 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  25.17 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.02 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  24.39 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  23.58 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.12 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.46 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  21.64 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.18 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
460 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
460 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  23.65 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.73 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  23.62 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 
662 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.35 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  25.41 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.13 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  28.14 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.76 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  23.64 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  22.07 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  21.38 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
727 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.63 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 
467 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.29 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.54 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
454 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 
483 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  26.2 
 
 
615 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
490 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  24.56 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.16 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  23.71 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.99 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 
366 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 
671 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
389 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0118  type II DNA-methyltransferase, putative  24.33 
 
 
463 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.617459  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
508 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
371 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.7 
 
 
360 aa  63.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.09 
 
 
359 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  24.67 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 
412 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  25.15 
 
 
426 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 
370 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 
657 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.66 
 
 
395 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.34 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.92 
 
 
423 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.27 
 
 
659 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
438 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  24.92 
 
 
423 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>