73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3183 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 424 aa  836    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  87.26 
 
 		 424 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  43.94 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  31.01 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3170  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4351  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 435 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.47272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2872  cell-surface polysaccharide exporter protein PST family  23.77 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0386  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.43 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  24.81 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  24.81 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  24.81 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  24.44 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  24.44 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  24.44 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  24.44 
 
 		 422 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.06 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 489 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  21.01 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  20.76 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  20.5 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  20.49 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  25.09 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 461 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  20.91 
 
 		 456 aa  46.6  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  24.56 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  24.5 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  23.2 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  21.16 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  23.93 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  26.34 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  25.25 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>