273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1654 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1654  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 383 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  28.73 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.15 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.98 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  25.41 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3808  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  23.33 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.27 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1067  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000716573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  27.52 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.25 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  31.25 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.25 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.25 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.25 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  31.25 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  31.33 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.02 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  30.59 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.13 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.98 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  22.83 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.68 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.98 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3170  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 622 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  32.26 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1388  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 643 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3041  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 622 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1989  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2276  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 622 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1300  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1012  heptosyltransferase family protein  35.8 
 
 		 628 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.25 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  23.22 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1381  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  30.64 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.13 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6448  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  27.72 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  20.74 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6040  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511032  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  27.37 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.04 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  23.8 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.03 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  27.68 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.96 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.89 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  22.92 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  31.65 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  31.65 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4883  glycosyl transferase family 9  30.11 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  0.0526108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  24.26 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3806  glycosyl transferase family 9  30.11 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  31.65 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  31.65 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  32.43 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  31.65 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  31.65 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.15 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  31.65 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.22 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  32 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.61 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  26.01 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>