More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0929 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  97.01 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  63.75 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  58.16 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  58.58 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  47.26 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  44.4 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.26 
 
 		 441 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29 
 
 		 454 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  29.87 
 
 		 443 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.17 
 
 		 591 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.17 
 
 		 587 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 		 442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  29.44 
 
 		 457 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  29.44 
 
 		 457 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.33 
 
 		 446 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  29.17 
 
 		 440 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0204  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  30.47 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 440 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.45 
 
 		 503 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 459 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  28.03 
 
 		 450 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  28.03 
 
 		 450 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.57 
 
 		 463 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  28.7 
 
 		 492 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.57 
 
 		 468 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 446 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.02 
 
 		 461 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.34 
 
 		 443 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  28.38 
 
 		 436 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.91 
 
 		 509 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  28.02 
 
 		 446 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  28.19 
 
 		 451 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.19 
 
 		 490 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.84 
 
 		 453 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.51 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  27.83 
 
 		 495 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  27.83 
 
 		 495 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29 
 
 		 566 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.06 
 
 		 439 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.61 
 
 		 453 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  27.83 
 
 		 495 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.63 
 
 		 480 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  30.32 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0991  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.34 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00365365  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.44 
 
 		 440 aa  99.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  27.27 
 
 		 436 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  27.83 
 
 		 494 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.07 
 
 		 476 aa  99.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 		 445 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.87 
 
 		 534 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.83 
 
 		 444 aa  98.6  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  27.59 
 
 		 441 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  27.75 
 
 		 453 aa  98.6  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  27.75 
 
 		 453 aa  98.6  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.43 
 
 		 450 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.84 
 
 		 518 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 460 aa  98.2  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 458 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.83 
 
 		 449 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  28.02 
 
 		 445 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.3 
 
 		 527 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  30.43 
 
 		 452 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  26.96 
 
 		 478 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  30.57 
 
 		 440 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  26.96 
 
 		 481 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30 
 
 		 469 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.44 
 
 		 439 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  27.39 
 
 		 480 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  26.52 
 
 		 472 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.03 
 
 		 455 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  28.7 
 
 		 507 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  29.49 
 
 		 472 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.71 
 
 		 498 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.71 
 
 		 721 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.03 
 
 		 519 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  27.27 
 
 		 449 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 450 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2993  chromosomal replication initiator, DnaA  31.06 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.87 
 
 		 562 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  28.7 
 
 		 557 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  27.19 
 
 		 452 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.75 
 
 		 458 aa  95.9  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 		 443 aa  95.5  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  29.95 
 
 		 453 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  29 
 
 		 524 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.66 
 
 		 454 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3564  chromosomal replication initiator, DnaA  31.65 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.33 
 
 		 477 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.57 
 
 		 458 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.57 
 
 		 458 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>