More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0001 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
460 aa  949    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  73.15 
 
 
452 aa  675    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  72.48 
 
 
464 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.21 
 
 
474 aa  523  1e-147  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.39 
 
 
519 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  49.18 
 
 
509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  49.34 
 
 
482 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.34 
 
 
477 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  48.25 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  50.9 
 
 
461 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 
455 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 
455 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  47.58 
 
 
477 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  45.61 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
472 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  42.13 
 
 
475 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
472 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  42.31 
 
 
473 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  42.55 
 
 
472 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 
475 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  53.31 
 
 
475 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  41.49 
 
 
475 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.19 
 
 
451 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  42.19 
 
 
451 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  39.38 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
455 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.91 
 
 
452 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.91 
 
 
452 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.86 
 
 
449 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  38 
 
 
498 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.43 
 
 
469 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  39.3 
 
 
501 aa  349  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  38.85 
 
 
458 aa  348  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 
452 aa  347  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 
501 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  39.25 
 
 
499 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  38.56 
 
 
501 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  38.18 
 
 
460 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 
445 aa  347  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
510 aa  346  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 
524 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  41.81 
 
 
457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.96 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 
451 aa  343  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  39.95 
 
 
446 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  39.95 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.8 
 
 
442 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  39.28 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  41.06 
 
 
457 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.28 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.18 
 
 
454 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  39.78 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  39.78 
 
 
450 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  40.45 
 
 
450 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  39.06 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  39.46 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  39.46 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 
462 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 
462 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 
462 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 
462 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 
461 aa  335  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
465 aa  335  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.03 
 
 
465 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  38.79 
 
 
450 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  41.04 
 
 
462 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 
451 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.08 
 
 
462 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.86 
 
 
464 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
460 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
452 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  37.24 
 
 
524 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.04 
 
 
463 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.03 
 
 
463 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
460 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
460 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.97 
 
 
483 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  37.64 
 
 
459 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.24 
 
 
444 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  40.96 
 
 
460 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.6 
 
 
453 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.12 
 
 
447 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  40.45 
 
 
462 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  40.45 
 
 
462 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  41.23 
 
 
459 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 
443 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.49 
 
 
449 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.06 
 
 
455 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  49.53 
 
 
450 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  49.38 
 
 
472 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  40.91 
 
 
461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  40.36 
 
 
467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>