282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7198 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  58.24 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  51.38 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  47.14 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  48.52 
 
 		 216 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  39.35 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  42.08 
 
 		 210 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  37.89 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  35.43 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 204 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 197 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  40.49 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.04 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  41.43 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  43.59 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  32.02 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  38.85 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  43.86 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  32.56 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  32.02 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  32.02 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  32.02 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  32.73 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.77 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  36.3 
 
 		 202 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.77 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.77 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  32.27 
 
 		 205 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 198 aa  99  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  40.71 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 191 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35.48 
 
 		 181 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 210 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 231 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  39.13 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  34.33 
 
 		 185 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  29.15 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.18 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 		 187 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.97 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  34.1 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.64 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 203 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 197 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 206 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 217 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  33.08 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  34.72 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  39.5 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.04 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  33.13 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  34.78 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  39.5 
 
 		 219 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  36.8 
 
 		 204 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  29.48 
 
 		 209 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  32.74 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 211 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 199 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 208 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>