83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5780 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5780  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  39.02 
 
 		 1143 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2366  polyketide synthase  38.64 
 
 		 1560 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  39.02 
 
 		 1593 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  41.46 
 
 		 2966 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.41 
 
 		 7279 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 3711 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  36.25 
 
 		 2376 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.44 
 
 		 3158 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  35.23 
 
 		 1601 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  34.74 
 
 		 4840 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 2374 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  41.46 
 
 		 3254 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  33.33 
 
 		 502 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2782  Beta-ketoacyl synthase  37.18 
 
 		 899 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0331764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35 
 
 		 4183 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  33.33 
 
 		 2024 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.16 
 
 		 1101 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 1837 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3702 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.83 
 
 		 3676 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3693 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 3693 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4744  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 491 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  31.03 
 
 		 1820 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.44 
 
 		 4080 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  39.29 
 
 		 1876 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  33.71 
 
 		 1616 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 3092 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  32.26 
 
 		 2846 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  33.33 
 
 		 2126 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  35.37 
 
 		 3408 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  29.89 
 
 		 4151 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.91 
 
 		 3679 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  29.91 
 
 		 3235 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 7110 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  38.03 
 
 		 4036 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6231  phosphopantetheine-binding  32.18 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1823 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  37.31 
 
 		 3355 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  35.71 
 
 		 3148 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  33.33 
 
 		 1573 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  30.61 
 
 		 3781 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 		 2367 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  30.61 
 
 		 3780 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  32.5 
 
 		 1375 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  32.5 
 
 		 2081 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  46.81 
 
 		 4930 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  31.4 
 
 		 1104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  34.67 
 
 		 3427 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.65 
 
 		 2462 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.06 
 
 		 2225 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.87 
 
 		 755 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  34.33 
 
 		 6768 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119561  polyketide synthase  31.18 
 
 		 4526 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  36.67 
 
 		 2666 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.21 
 
 		 3449 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0204  peptide synthetase, putative  40 
 
 		 983 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 1816 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 1584 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  30.59 
 
 		 3645 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 1874 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 5154 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  32.93 
 
 		 1537 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  29.33 
 
 		 1577 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4359  Acyl transferase  40.68 
 
 		 3208 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 3874 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  32.1 
 
 		 3033 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  27.45 
 
 		 7157 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  31.58 
 
 		 7210 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 		 3786 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  36.84 
 
 		 649 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.23 
 
 		 1559 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  29.23 
 
 		 1559 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1573  thioesterase  29.67 
 
 		 561 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 1828 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  26.47 
 
 		 1354 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  30.93 
 
 		 5612 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  33.33 
 
 		 2890 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2424  non-ribosomal peptide synthetase  30.26 
 
 		 1178 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  34.21 
 
 		 1190 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 2060 aa  40  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  31.52 
 
 		 3176 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>