43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5633 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  100 
 
 		 228 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  72.9 
 
 		 188 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  46.94 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  42.36 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  41.96 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  44.52 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  43.23 
 
 		 174 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  41.32 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  42.75 
 
 		 138 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  38.62 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  42.57 
 
 		 151 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  39.55 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  40.22 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  40.77 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  41.18 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  46.36 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  32.79 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  34.11 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  37.12 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  42.31 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  43.27 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  31.14 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  41.26 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  37.23 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  36.43 
 
 		 167 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  40.43 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  27.74 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  28.28 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  39.36 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  38.46 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  38.6 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  28.57 
 
 		 159 aa  52.4  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  32.24 
 
 		 158 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.94 
 
 		 364 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  35.83 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  22.9 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  27.97 
 
 		 360 aa  45.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  27.69 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3604  DoxX family protein  36.76 
 
 		 129 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.293818 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1811  DoxX family protein  38.71 
 
 		 366 aa  41.6  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.217697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>