More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5104 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 839 aa  1647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  67.7 
 
 		 670 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  47.25 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.2 
 
 		 702 aa  479  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  45.69 
 
 		 727 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.62 
 
 		 583 aa  436  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.47 
 
 		 635 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  41.88 
 
 		 653 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.2 
 
 		 655 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 		 682 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 607 aa  366  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  40.99 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.15 
 
 		 754 aa  357  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 		 692 aa  357  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 		 618 aa  355  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 		 677 aa  351  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.63 
 
 		 716 aa  350  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.96 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.76 
 
 		 663 aa  343  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  40.21 
 
 		 716 aa  343  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.65 
 
 		 657 aa  341  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.95 
 
 		 579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 662 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 		 642 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 		 642 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 		 642 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  37.38 
 
 		 635 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  36.7 
 
 		 657 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 600 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  38.39 
 
 		 656 aa  332  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  38.69 
 
 		 657 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  38.81 
 
 		 708 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 654 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.43 
 
 		 586 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  37.09 
 
 		 652 aa  325  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 657 aa  324  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 		 600 aa  323  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.96 
 
 		 637 aa  322  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  36.78 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 		 634 aa  314  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  36.63 
 
 		 660 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  35.46 
 
 		 695 aa  313  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.61 
 
 		 553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.26 
 
 		 582 aa  307  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  36.23 
 
 		 579 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  36.23 
 
 		 579 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.27 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 		 578 aa  299  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 619 aa  298  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  35.93 
 
 		 585 aa  298  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  34.79 
 
 		 729 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 583 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  35.35 
 
 		 579 aa  297  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 583 aa  297  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 		 586 aa  296  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 578 aa  296  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  35.04 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  36.82 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  35.76 
 
 		 711 aa  295  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.5 
 
 		 571 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 548 aa  293  8e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 578 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 		 584 aa  292  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 631 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 		 576 aa  290  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  34.79 
 
 		 595 aa  290  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 		 613 aa  290  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.57 
 
 		 568 aa  290  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 		 613 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 582 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 671 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  34.3 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 595 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  34.3 
 
 		 565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 		 570 aa  288  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  37.09 
 
 		 570 aa  288  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 		 582 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 705 aa  286  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 595 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 		 614 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 578 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.86 
 
 		 582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  35.01 
 
 		 588 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  35.01 
 
 		 588 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 587 aa  284  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  35.01 
 
 		 588 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  35.01 
 
 		 588 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  34.56 
 
 		 600 aa  284  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  35.01 
 
 		 588 aa  284  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  36.15 
 
 		 575 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 582 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 		 582 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 587 aa  282  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  35.86 
 
 		 605 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  36.28 
 
 		 622 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 590 aa  280  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>