269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4724 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4724  taurine dioxygenase  100 
 
 
276 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.980038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.35 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.35 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  37.55 
 
 
277 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.35 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.35 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.35 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.35 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  37.91 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  38.58 
 
 
282 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  38.58 
 
 
282 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  38.58 
 
 
282 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  35.56 
 
 
282 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.97 
 
 
283 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.97 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  39.05 
 
 
293 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  37.08 
 
 
283 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  36.82 
 
 
277 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  37.18 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  36.82 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  38.91 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  37.59 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  36.46 
 
 
291 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  38.95 
 
 
282 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  35.61 
 
 
278 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  34.77 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  34.48 
 
 
307 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  37.09 
 
 
277 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  36.92 
 
 
335 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  37.09 
 
 
277 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  37.45 
 
 
304 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  36.3 
 
 
285 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  36.73 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  36.67 
 
 
281 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  33.92 
 
 
289 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  36.36 
 
 
276 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  33.09 
 
 
270 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  34.62 
 
 
271 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  35.19 
 
 
289 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  32.29 
 
 
315 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 
292 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  37.59 
 
 
292 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  32.13 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  35.96 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  36.3 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  34.84 
 
 
305 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  34.2 
 
 
295 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  35.82 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  32.38 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  33.22 
 
 
318 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  31.79 
 
 
289 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  35.74 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 
363 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  32.84 
 
 
305 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  31.64 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  32.33 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  30.8 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.27 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  30.85 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  30.6 
 
 
318 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.38 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  34 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.13 
 
 
301 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.64 
 
 
305 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  34.03 
 
 
282 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  30.8 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  33.69 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  29.97 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  32.88 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  33.78 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  31.27 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43041  predicted protein  31.1 
 
 
383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  31.27 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  33.95 
 
 
273 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
316 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  31.75 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  33.68 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  32.27 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  31.38 
 
 
315 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  33.9 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
282 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  30.6 
 
 
317 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  32.73 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  33.69 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  31.02 
 
 
317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  31.73 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  30.8 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  30.53 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  33.46 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  30.36 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  31.88 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  31.9 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  31.02 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  30.6 
 
 
306 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  33.58 
 
 
306 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>