289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1374 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  64.06 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  41.67 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  42.39 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  42.91 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  42.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  42.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  42.6 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  41.79 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  41.79 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  42.81 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  42.81 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  42.81 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  42.51 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  43.93 
 
 		 277 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  41.88 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  45.9 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  43.57 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  43.14 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  41.52 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  42.24 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  42.24 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  41.3 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  42.18 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  41.84 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.12 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  41.85 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  40.78 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.14 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  38.87 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  41.13 
 
 		 314 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  38.54 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  42.54 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  39.87 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  40.43 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  43.53 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  41.39 
 
 		 309 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  41.84 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.66 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  42.39 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  39.11 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  41.03 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  40.65 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  39.71 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  42.11 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  42.11 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  42.11 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  42.11 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  42.11 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  41.13 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  41.84 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  41.24 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  39.02 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  38.23 
 
 		 317 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  41.75 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  44.09 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  44.09 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  44.09 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  42.28 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  42.03 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  41.07 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  40.14 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.36 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  40.37 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  37.21 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  37.14 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  40.14 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  36.33 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  41.45 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  40.14 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  40.36 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  41.84 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  34.54 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  38.95 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  35.92 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  37.75 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  38.21 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  36.2 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  38.32 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  35.46 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  40.94 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  40.43 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  38.75 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  36.82 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  37.06 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  41.13 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>