272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4563 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  81.85 
 
 		 282 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  81.85 
 
 		 282 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  81.85 
 
 		 282 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  81.91 
 
 		 283 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  82.27 
 
 		 283 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  77.66 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  61.82 
 
 		 277 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  61.82 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  61.82 
 
 		 277 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  60.36 
 
 		 277 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  62.18 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  61.82 
 
 		 277 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  58.84 
 
 		 280 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  55.8 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  53.62 
 
 		 277 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  53.62 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  53.62 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  44.2 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  46.62 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  43.32 
 
 		 307 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  42.16 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  42.75 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  42.86 
 
 		 304 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  41.88 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  41.61 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  46.04 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  41.49 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  40.81 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.09 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  43.12 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  41.73 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  38.28 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  40.85 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  42.7 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  40.43 
 
 		 305 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  42.76 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 303 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.56 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  40 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  38.99 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  40.58 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  40 
 
 		 299 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  40.14 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  40 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  38.83 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  38.27 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  39.31 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  39.44 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  38.03 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  37.85 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  38.19 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  38.97 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  37.11 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  39.39 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.28 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  40 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  38.75 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  37.94 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 282 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  38.73 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  38.73 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  37.45 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  39.58 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  38.7 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  39.66 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  37.82 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  38.49 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  37.37 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  36.86 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  38.38 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  37.37 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  37.37 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  40.14 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  37.37 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.1 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  40.14 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  37.37 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  37.37 
 
 		 292 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 317 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  38.33 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  37.01 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>