273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1665 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  100 
 
 
303 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  76.6 
 
 
282 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  74.83 
 
 
306 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  74.47 
 
 
299 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  74.47 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  74.47 
 
 
282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  74.82 
 
 
282 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  74.11 
 
 
282 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  76.24 
 
 
282 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  76.24 
 
 
282 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  72.76 
 
 
282 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  71.63 
 
 
282 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  72.04 
 
 
282 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  75.53 
 
 
282 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  75.18 
 
 
282 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  72.34 
 
 
282 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  75.53 
 
 
282 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  75.53 
 
 
282 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  70.97 
 
 
282 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  70.21 
 
 
282 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  67.38 
 
 
281 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  66.31 
 
 
281 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  66.31 
 
 
280 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  63.12 
 
 
281 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  64.18 
 
 
280 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  50 
 
 
295 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  54.35 
 
 
301 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  50.82 
 
 
305 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  52.1 
 
 
297 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  51.09 
 
 
304 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  47.12 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  48.07 
 
 
285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  42.86 
 
 
295 aa  235  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  44.79 
 
 
307 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  40.91 
 
 
272 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.83 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  39.93 
 
 
282 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  37.67 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  40.48 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  40.27 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  36.55 
 
 
278 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  39.93 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  39.93 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  39.93 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.79 
 
 
277 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.46 
 
 
305 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  38.41 
 
 
287 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  40.85 
 
 
277 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  40.85 
 
 
335 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  40.14 
 
 
315 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  40.07 
 
 
270 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  40.49 
 
 
277 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  40.71 
 
 
282 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  38.87 
 
 
273 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  38.69 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.46 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  39.72 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.33 
 
 
283 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  36.99 
 
 
283 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
283 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
283 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
277 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  36.99 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  38.78 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
277 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  39.93 
 
 
309 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  37.16 
 
 
291 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  38.6 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  36.73 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  33.12 
 
 
316 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  37.88 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
315 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
315 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  35.71 
 
 
280 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  37.88 
 
 
315 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  38.7 
 
 
288 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  36.9 
 
 
304 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  39.1 
 
 
309 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  38 
 
 
308 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  36.81 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  38.41 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  37.09 
 
 
318 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  36.08 
 
 
314 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  35.76 
 
 
315 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  36.39 
 
 
301 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36 
 
 
381 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  36.43 
 
 
318 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  36.08 
 
 
317 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
323 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  37.02 
 
 
282 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  34.07 
 
 
306 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  34.45 
 
 
316 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  35.4 
 
 
298 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  36.58 
 
 
310 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  36.46 
 
 
271 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  36.18 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>