272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3847 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  81.56 
 
 		 282 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  78.37 
 
 		 299 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  78.01 
 
 		 282 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  78.01 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  77.66 
 
 		 282 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  79.08 
 
 		 282 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  79.79 
 
 		 282 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  78.37 
 
 		 282 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  79.79 
 
 		 282 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  77.3 
 
 		 282 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  80.14 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  80.14 
 
 		 282 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  79.43 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  79.43 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  79.43 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  79.08 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  75.18 
 
 		 306 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  74.47 
 
 		 282 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  72.34 
 
 		 303 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  66.31 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  63.12 
 
 		 280 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  62.77 
 
 		 281 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  58.66 
 
 		 281 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  57.95 
 
 		 281 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  54.15 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  52.86 
 
 		 295 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  54.29 
 
 		 297 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  54.42 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  53.99 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  51.8 
 
 		 301 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  45.26 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  44.83 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  44.88 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.21 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  44.56 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  44.56 
 
 		 335 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  44.56 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  43.05 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  38.75 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  41.03 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  40 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  40.69 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  39.66 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.57 
 
 		 277 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  40.62 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  40.62 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  40.62 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.88 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  40.56 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  41.26 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  35.99 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  39.58 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  38.36 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  40.96 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  41.64 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  39.45 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 309 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.98 
 
 		 381 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  37.02 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  35.19 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  39.53 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  36.68 
 
 		 318 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  38.83 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  37.8 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  37.8 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  37.8 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  36.68 
 
 		 317 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  37.98 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.76 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  35.05 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  37.58 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  37.5 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  36.62 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  39.72 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.88 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  37.88 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  37.5 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  35.21 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  34.69 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  36.9 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  36.55 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  36.59 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>