270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3506 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  100 
 
 
317 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  98.11 
 
 
317 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  97.79 
 
 
317 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  94.95 
 
 
317 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  93.69 
 
 
314 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  90.88 
 
 
318 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  90.22 
 
 
317 aa  563  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  82.37 
 
 
316 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  71.08 
 
 
300 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  70.03 
 
 
300 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  69.05 
 
 
301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  67.61 
 
 
301 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  67.37 
 
 
310 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  63.21 
 
 
309 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  59.74 
 
 
316 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  63.32 
 
 
305 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  62.54 
 
 
309 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  61.36 
 
 
306 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  60.07 
 
 
333 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  62.77 
 
 
298 aa  355  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  56.54 
 
 
316 aa  349  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  58.19 
 
 
304 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  56.79 
 
 
312 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  58.87 
 
 
301 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  57.49 
 
 
319 aa  338  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  58.68 
 
 
305 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  59.52 
 
 
308 aa  331  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  56.18 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  57.69 
 
 
308 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  54.79 
 
 
303 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  52.72 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  54.2 
 
 
305 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  54.2 
 
 
305 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  54.2 
 
 
305 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  54.3 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  51.05 
 
 
295 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  51.07 
 
 
318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  52.41 
 
 
293 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  47.55 
 
 
316 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  48.12 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  47.44 
 
 
306 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  48.58 
 
 
297 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  47.69 
 
 
322 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  45.78 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  46.38 
 
 
309 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  42.9 
 
 
308 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  44.2 
 
 
277 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  43.48 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  41.9 
 
 
281 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  40.94 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  41.33 
 
 
315 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  42 
 
 
315 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.33 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  39.64 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  41.08 
 
 
323 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  40.07 
 
 
306 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  42.43 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  42.11 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  40.67 
 
 
315 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  41.78 
 
 
315 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  40.94 
 
 
277 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  41.45 
 
 
315 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  40.58 
 
 
277 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  40.58 
 
 
277 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  40.22 
 
 
291 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.41 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
283 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  40.55 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  38.08 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  43.01 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  42.23 
 
 
335 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  39.13 
 
 
282 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  37.89 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  42.81 
 
 
277 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  37.32 
 
 
283 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  41.58 
 
 
295 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  37.19 
 
 
292 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  37.14 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  37.54 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  37.54 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  37.54 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  37.54 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  37.54 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  39.16 
 
 
282 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  36.1 
 
 
267 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  42.65 
 
 
277 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  37.19 
 
 
292 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
281 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  38.72 
 
 
307 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  38.01 
 
 
299 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  38.43 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  38.43 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  38.43 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  39.1 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>