273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2520 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  100 
 
 
292 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  99.66 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  99.66 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  99.66 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  99.66 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  99.66 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  99.32 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  96.15 
 
 
292 aa  577  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  41.46 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  42.61 
 
 
281 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  41.43 
 
 
322 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  40.7 
 
 
277 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  37.77 
 
 
285 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  38.79 
 
 
278 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.35 
 
 
277 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  39.3 
 
 
277 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.8 
 
 
315 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  41.75 
 
 
306 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
277 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  39.24 
 
 
312 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.54 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  39.57 
 
 
270 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.5 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  39.5 
 
 
277 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  40.21 
 
 
277 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  40.33 
 
 
318 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  38.24 
 
 
310 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.25 
 
 
291 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  39.15 
 
 
277 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  38.25 
 
 
300 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  38.25 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  36.17 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  38.38 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  38.03 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.49 
 
 
305 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  38.25 
 
 
308 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  38.44 
 
 
301 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  37.01 
 
 
282 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  37.15 
 
 
306 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.67 
 
 
315 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  35.54 
 
 
309 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  37.19 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  37.19 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  35.54 
 
 
309 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  37.19 
 
 
317 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  39.18 
 
 
308 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  37.68 
 
 
317 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  38.77 
 
 
276 aa  178  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  39.43 
 
 
293 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  37.19 
 
 
317 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  38.1 
 
 
309 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.24 
 
 
381 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  37.68 
 
 
304 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  38.46 
 
 
305 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  38.32 
 
 
271 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  36.52 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  35.67 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  33.79 
 
 
316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  37.59 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  36.64 
 
 
315 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.81 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  37.23 
 
 
304 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  35.97 
 
 
295 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
323 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  35.94 
 
 
307 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.82 
 
 
282 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.82 
 
 
282 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.82 
 
 
282 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  36.9 
 
 
315 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  36.33 
 
 
299 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  34.88 
 
 
283 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  36.05 
 
 
299 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  35.64 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  35.23 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  35.99 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  34.93 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  35.29 
 
 
299 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  36.27 
 
 
299 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.54 
 
 
295 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  35.66 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  36 
 
 
309 aa  165  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  35.4 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  37.91 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  34.83 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  35.62 
 
 
308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  36.05 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  34.71 
 
 
315 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  35.71 
 
 
305 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  38.3 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  35.94 
 
 
305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>