282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1366 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  100 
 
 		 308 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  41.11 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  39.08 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  39.18 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  39.73 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  39.18 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  39.18 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  40.65 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  38.83 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  39.18 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  39.18 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  39.18 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  39.18 
 
 		 283 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.73 
 
 		 277 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.83 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  39.86 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  37.8 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  37.85 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  37.85 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  37.85 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.64 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  37.33 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  38.06 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  35.17 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0930  putative taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.24 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149442  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  37.67 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  35.96 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  34.48 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  35.42 
 
 		 264 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  36.64 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.64 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21960  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA family  33.22 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  35.27 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  33.22 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  36.64 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  34.63 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  34.27 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  35.27 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  35.2 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  33.77 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  34.24 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  34.83 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.49 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  35.62 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  34.74 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  35.27 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  35.27 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  35.27 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  35.27 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  35.27 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  35.27 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  34.69 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  34.45 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  34.15 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  33.9 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  33.68 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  33.44 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  34 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  32.99 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  33.99 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  36.52 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  32.89 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  33.56 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  33.11 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  31.31 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  32.89 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  32.89 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  31.19 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  30.46 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  32.3 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.31 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  31.79 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  31.65 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  34.01 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  35.46 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  32.18 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  33.11 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  34.26 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  32.21 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  31.53 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  32.53 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  32.77 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  32.48 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  34.74 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  30.12 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  30.12 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  34.17 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  34.38 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  34.26 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  30.56 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  32.78 
 
 		 280 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  32.48 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  34.47 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  32.67 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>