271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4891 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  41.54 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  39.01 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.99 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  40.65 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  38.87 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  38.85 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.5 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.66 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  39.65 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  41.24 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.01 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  40.23 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.85 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  42.01 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.01 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  38.38 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  37.64 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21960  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA family  40.15 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.64 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.03 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  39.65 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  36.9 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  37.19 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.96 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.96 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.87 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  39.78 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.19 
 
 		 277 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  37.59 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  38.52 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  38.85 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  37.59 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  38.16 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  38.25 
 
 		 299 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  38.95 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.69 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  39.93 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  39.93 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  36.4 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  35.69 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  37.89 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  37.73 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  37.73 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.8 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  37.13 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  37.36 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  39.34 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  35.51 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  36.4 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  37.96 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  36.06 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  36.06 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  36.06 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  34.56 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  34.69 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.13 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  34.3 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  35.13 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  35.97 
 
 		 322 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  33.21 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  36.43 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  35.92 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  33.21 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  32.86 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  34.41 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  36.2 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  35.29 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  33.09 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  34.52 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51444  taurine catabolism dioxygenase  34.46 
 
 		 424 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.353625  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28893  predicted protein  34.16 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  32.97 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  36.5 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.2 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  35.56 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  36.65 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  34.8 
 
 		 388 aa  135  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  34.35 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  36.97 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  35.32 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>