272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4751 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  100 
 
 
304 aa  634    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  83.87 
 
 
295 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  65.56 
 
 
305 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  71.68 
 
 
301 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  69.04 
 
 
301 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  66.9 
 
 
297 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  54.15 
 
 
282 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  53.33 
 
 
285 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  54.18 
 
 
280 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  51.09 
 
 
303 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  51.8 
 
 
281 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  53.07 
 
 
299 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  52.31 
 
 
299 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  51.61 
 
 
281 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  51.25 
 
 
281 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  52.71 
 
 
306 aa  288  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  52.36 
 
 
280 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  53.43 
 
 
282 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  52.31 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  51.6 
 
 
282 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  53.43 
 
 
282 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  53.07 
 
 
282 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  51.25 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  53.07 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  50.89 
 
 
282 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.26 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  51.62 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  51.62 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.62 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.62 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.62 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  49.12 
 
 
307 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  51.26 
 
 
282 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  45.27 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  235  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  44.41 
 
 
283 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  44.41 
 
 
283 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  44.37 
 
 
277 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  42.81 
 
 
277 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.37 
 
 
277 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  41.18 
 
 
277 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  41.18 
 
 
277 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  43.36 
 
 
277 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  43.36 
 
 
335 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  42.12 
 
 
277 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  43.36 
 
 
277 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  41.26 
 
 
283 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  41.05 
 
 
282 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  41.05 
 
 
282 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  41.05 
 
 
282 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  40.83 
 
 
291 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  42.86 
 
 
282 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  39.24 
 
 
280 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  41.82 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  39.37 
 
 
270 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  38.79 
 
 
271 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  40.78 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  40.28 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  39.07 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.29 
 
 
305 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  37.9 
 
 
290 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  41.64 
 
 
282 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  37.86 
 
 
278 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  39.58 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  40.78 
 
 
318 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  38.43 
 
 
315 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  37.01 
 
 
315 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.46 
 
 
315 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  41.13 
 
 
306 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  41.11 
 
 
322 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  37.63 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  36.86 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  38.33 
 
 
289 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.23 
 
 
298 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  37.98 
 
 
288 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  37.37 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  38.85 
 
 
273 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  36.49 
 
 
273 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  37.37 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
299 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  39.58 
 
 
286 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  35.76 
 
 
315 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  37.37 
 
 
299 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  39.36 
 
 
276 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  34.25 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  34.84 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  34.16 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  37.59 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  38.13 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  38.13 
 
 
317 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  33.98 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  34.3 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  36.93 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  35.79 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  36.33 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>