272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2717 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  100 
 
 
305 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  69.55 
 
 
297 aa  434  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  70.38 
 
 
301 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  69.82 
 
 
295 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  65.56 
 
 
304 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  61.77 
 
 
301 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  55.87 
 
 
282 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  54.58 
 
 
299 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  50.82 
 
 
303 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  56.29 
 
 
306 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  54.23 
 
 
299 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  54.8 
 
 
282 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  54.42 
 
 
282 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  55.48 
 
 
282 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  51.92 
 
 
285 aa  290  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  52.31 
 
 
280 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  53.19 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  50.71 
 
 
281 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  54.06 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  50.71 
 
 
281 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  53.9 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  54.26 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  54.26 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  53.9 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  53.9 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  53.55 
 
 
282 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  53.71 
 
 
282 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  50.71 
 
 
281 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  51.26 
 
 
280 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.59 
 
 
282 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  52.54 
 
 
307 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  53 
 
 
282 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  51.25 
 
 
282 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  45.07 
 
 
295 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  43.26 
 
 
280 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  44.04 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  39.93 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  40.93 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  40.93 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  42.96 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.24 
 
 
277 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  40.41 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  40.41 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  40.41 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  46.15 
 
 
282 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.59 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.19 
 
 
277 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  39.01 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  37.85 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  41.05 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  41.38 
 
 
335 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  41.38 
 
 
277 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  41.38 
 
 
277 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  40.21 
 
 
283 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  39.5 
 
 
270 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  40.43 
 
 
282 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  37.94 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  39.68 
 
 
290 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  40.07 
 
 
288 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  39.72 
 
 
278 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  39.01 
 
 
273 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  41.07 
 
 
287 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  40.97 
 
 
289 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  41.11 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.28 
 
 
305 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  38.71 
 
 
271 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.89 
 
 
315 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  39.3 
 
 
315 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  37.89 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  38.39 
 
 
318 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  40.28 
 
 
289 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  39.3 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  35.46 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  37.89 
 
 
315 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  37.33 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  39.01 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.41 
 
 
321 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  38.95 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  36.6 
 
 
315 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  38.95 
 
 
315 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  37.76 
 
 
293 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  36.84 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  38.6 
 
 
281 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  40.75 
 
 
309 aa  175  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  36.91 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  38.33 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  36.07 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  37.1 
 
 
276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  37.63 
 
 
299 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  36.36 
 
 
302 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  34.71 
 
 
308 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  36.81 
 
 
323 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  34.75 
 
 
287 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  34.84 
 
 
302 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>