272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4017 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  98.73 
 
 
315 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  97.46 
 
 
315 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  96.19 
 
 
315 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  81.9 
 
 
315 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  81.9 
 
 
315 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  80.32 
 
 
315 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  69 
 
 
323 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  65.25 
 
 
318 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  50.8 
 
 
315 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  53.36 
 
 
309 aa  291  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  51.99 
 
 
308 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.15 
 
 
321 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.73 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  40.97 
 
 
285 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  40.75 
 
 
282 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  41.11 
 
 
278 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  45.36 
 
 
272 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  38.87 
 
 
316 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  41.28 
 
 
301 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  42.41 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  41.36 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  40.13 
 
 
303 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  43.09 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  43.09 
 
 
317 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  40.07 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  42.02 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  42.43 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  42.76 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  42.43 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  41.36 
 
 
309 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  38.57 
 
 
270 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  42.71 
 
 
317 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  42.11 
 
 
317 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  42.09 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  40.94 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  42.11 
 
 
314 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  39.2 
 
 
316 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  39 
 
 
271 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  40.68 
 
 
309 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.06 
 
 
283 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
283 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  41.37 
 
 
295 aa  188  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.06 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
283 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.72 
 
 
283 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.58 
 
 
277 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  40.62 
 
 
305 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  37.42 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  38.46 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  37.54 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  41.35 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  38.03 
 
 
298 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  42.05 
 
 
309 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  39.55 
 
 
300 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 
363 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  36.1 
 
 
282 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  37.58 
 
 
295 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  41.12 
 
 
301 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  40.84 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  40.84 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  40.84 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  37.5 
 
 
322 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  38.95 
 
 
305 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
303 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.52 
 
 
277 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  37.37 
 
 
304 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  37.5 
 
 
287 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.52 
 
 
277 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  37.46 
 
 
280 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  37.33 
 
 
291 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  37.58 
 
 
318 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  37.06 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  36.22 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  34.95 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  37.67 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  36.67 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  39.61 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  38.36 
 
 
293 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  38.26 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  39.22 
 
 
277 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.22 
 
 
277 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  38.38 
 
 
307 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  41.12 
 
 
301 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  38.26 
 
 
293 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  38.25 
 
 
282 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  38.16 
 
 
308 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.79 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.79 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.79 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  39.33 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.86 
 
 
280 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  35.43 
 
 
289 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  37.02 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  36.99 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  39.49 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  36.43 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>