270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3036 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  88.7 
 
 		 307 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  62.75 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  58.56 
 
 		 293 aa  324  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  51.67 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  52.2 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  48.81 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  48.87 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  48.68 
 
 		 309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  49.83 
 
 		 300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  49.83 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  49.5 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  49.5 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  49.5 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  46.05 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  48.78 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  48.12 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  48.28 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  46.8 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  47.44 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  47.44 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  47.44 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  47.1 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  47.1 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  47.4 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  47.06 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  48.78 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  48.26 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  45.45 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  44.37 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  46.79 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  47.16 
 
 		 309 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  44.55 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  43.17 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  44.44 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  41.61 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  41.55 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  42.18 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  41.64 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  41.16 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  40.55 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  41.03 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  41.36 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  41.02 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  40.4 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  40.54 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  40.26 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  39.4 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.76 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  41.01 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  39.67 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  40.43 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  37.63 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  38.19 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  40.43 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.39 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.71 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  40 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  37.72 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  39.5 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  37.54 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.92 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.73 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  36.88 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  34.64 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  37.17 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  34.26 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  36.33 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  35.71 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  36.26 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  36.49 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  34.81 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  33.21 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.05 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  33.09 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  31.36 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  34.26 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  36.88 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  35.05 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  35.94 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  33.92 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  33.56 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  37.32 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  36.33 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  34.03 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  33.57 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>