274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4934 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  62.54 
 
 
308 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  62.12 
 
 
301 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  59.58 
 
 
301 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  58.45 
 
 
300 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  61.25 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  59.4 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  60.54 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  60.54 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  60.54 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  60.54 
 
 
318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  57.09 
 
 
300 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  59.52 
 
 
317 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  59.52 
 
 
317 aa  331  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  58.16 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  58.16 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  58.16 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  58.89 
 
 
301 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  55.41 
 
 
303 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  58.62 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  58.25 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  57.09 
 
 
316 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  54.67 
 
 
306 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  57.89 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  52.67 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  52.51 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  57.14 
 
 
316 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  55.63 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  51.67 
 
 
306 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  53.17 
 
 
381 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  51.99 
 
 
316 aa  295  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  56.29 
 
 
305 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  52.45 
 
 
304 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  50.5 
 
 
307 aa  291  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  53.31 
 
 
298 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  45.87 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  49.65 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  51.37 
 
 
319 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  48.99 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  48.15 
 
 
318 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  51.36 
 
 
293 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  48.04 
 
 
297 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  46.62 
 
 
315 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  44.77 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  43.81 
 
 
308 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  41.72 
 
 
315 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  42.04 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  42.36 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  43.97 
 
 
322 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  42.47 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  42.57 
 
 
323 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.4 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  41.24 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  41.03 
 
 
306 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  40.71 
 
 
315 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  41.3 
 
 
281 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  42.28 
 
 
315 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  42.09 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  38.69 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  38.8 
 
 
318 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  41.41 
 
 
315 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  38.68 
 
 
292 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  40.96 
 
 
282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  38.7 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  41.24 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  39.39 
 
 
306 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  38.38 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  38.38 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  38.38 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  38.38 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  38.38 
 
 
292 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  36.33 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  38.25 
 
 
292 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  38.38 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  37.42 
 
 
299 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  38.46 
 
 
299 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  42.4 
 
 
277 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  36.65 
 
 
278 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
282 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  41.7 
 
 
277 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  39.01 
 
 
283 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  37.97 
 
 
282 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  38.21 
 
 
285 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.65 
 
 
283 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.65 
 
 
283 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  38.91 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  38.28 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  38.91 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.65 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.65 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.65 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.65 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.65 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.57 
 
 
282 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.57 
 
 
282 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.57 
 
 
282 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.23 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  37.93 
 
 
282 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  40.49 
 
 
277 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.52 
 
 
280 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>