272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3935 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  81.85 
 
 		 282 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  76.16 
 
 		 283 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  76.51 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  76.16 
 
 		 283 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  76.51 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  76.16 
 
 		 283 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  75.8 
 
 		 283 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  63.14 
 
 		 277 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  62.04 
 
 		 277 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  61.37 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  61.31 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  60.95 
 
 		 277 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  60.22 
 
 		 277 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  60.58 
 
 		 277 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  56.36 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  55.27 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  55.27 
 
 		 277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  54.91 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  48.5 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  42.51 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  44.04 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  41.97 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  42.81 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  41.05 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  41.2 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  41.94 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  40.41 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  41.26 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  40.86 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  37.73 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  45.09 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  42.26 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  38.6 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  38.77 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  41.03 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.15 
 
 		 305 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  39.66 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  40.29 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  40.62 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.75 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  38.91 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  38.26 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  38.11 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  38.93 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  37.85 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  36.86 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  37.09 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  36.65 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  38.11 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 		 363 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  37.92 
 
 		 276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  37.06 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  41.01 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  36.56 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  37.82 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  36.84 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4724  taurine dioxygenase  38.58 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  37.41 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.73 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  38.08 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  36.84 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  39.55 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  39.55 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  35.84 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.16 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  37.1 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  37.76 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  37.82 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  36.75 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  36.75 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  40 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  35.02 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  40.29 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  38.11 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  37.41 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.14 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  36.14 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  37.76 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  37.99 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.84 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  37.19 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.76 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  36.54 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  37.81 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.36 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>