276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1602 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  100 
 
 
281 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  95.02 
 
 
281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  82.14 
 
 
281 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  65.84 
 
 
280 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  65.12 
 
 
280 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  66.31 
 
 
303 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  63.6 
 
 
282 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  62.19 
 
 
282 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  62.19 
 
 
299 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  61.84 
 
 
282 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  61.84 
 
 
306 aa  358  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  62.72 
 
 
282 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  62.37 
 
 
282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  60.42 
 
 
282 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  60.78 
 
 
282 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  60.42 
 
 
282 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  61.65 
 
 
282 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  63.6 
 
 
282 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  63.6 
 
 
282 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  63.25 
 
 
282 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  63.25 
 
 
282 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  63.25 
 
 
282 aa  351  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  62.9 
 
 
282 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  59.36 
 
 
299 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  58.66 
 
 
282 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  52.88 
 
 
301 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  51.25 
 
 
304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  50.71 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  52.19 
 
 
297 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  50.71 
 
 
305 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  46.24 
 
 
301 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  45.85 
 
 
307 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  43.21 
 
 
285 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  42.05 
 
 
295 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  42.76 
 
 
304 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  42.07 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  42.07 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.42 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  42.32 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.83 
 
 
277 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  41.03 
 
 
277 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  38.14 
 
 
277 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.83 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.8 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.72 
 
 
277 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  41.3 
 
 
308 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.83 
 
 
291 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  38.14 
 
 
283 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  38.19 
 
 
282 aa  188  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.37 
 
 
305 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  39.24 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
282 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
282 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
282 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  37.68 
 
 
272 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  36.65 
 
 
316 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  37.29 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  37.29 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  38.41 
 
 
314 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.38 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.98 
 
 
381 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  38.98 
 
 
290 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
318 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  37.68 
 
 
314 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  38.06 
 
 
317 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  38.51 
 
 
288 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  37.76 
 
 
304 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.84 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  35.46 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  37.72 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  37.37 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  37.72 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  37.5 
 
 
301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  35.69 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  37.37 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  36.9 
 
 
315 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.08 
 
 
315 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  37.41 
 
 
295 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  38.44 
 
 
308 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  39.36 
 
 
293 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  35.4 
 
 
315 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  37.72 
 
 
316 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  38.46 
 
 
316 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  37.72 
 
 
282 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  36.46 
 
 
298 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  36.39 
 
 
316 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  36.52 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  34.88 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  36.3 
 
 
297 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  36.86 
 
 
310 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  35.56 
 
 
276 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  35.52 
 
 
309 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  35.52 
 
 
300 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>