272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0686 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  49.65 
 
 
308 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  50.35 
 
 
295 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  50 
 
 
314 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  49.29 
 
 
317 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  49.29 
 
 
333 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  47.16 
 
 
381 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  48.07 
 
 
309 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  49.28 
 
 
309 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  48.94 
 
 
317 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  48.58 
 
 
317 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  48.58 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  47.39 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  47.87 
 
 
317 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  47.87 
 
 
317 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  46.05 
 
 
305 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  46.05 
 
 
305 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  46.05 
 
 
305 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  47.9 
 
 
316 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  46.71 
 
 
309 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  48.04 
 
 
308 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  47.14 
 
 
300 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  50.18 
 
 
305 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  44.78 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  45.21 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  46.79 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.76 
 
 
305 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  45.07 
 
 
306 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  45.58 
 
 
301 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  42.47 
 
 
318 aa  232  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  44.21 
 
 
305 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  45.49 
 
 
310 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  42.96 
 
 
316 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  40.57 
 
 
316 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  44.64 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  45.14 
 
 
298 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  42.41 
 
 
312 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  42.25 
 
 
303 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  44.6 
 
 
319 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  43.3 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  41.03 
 
 
306 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  39.37 
 
 
307 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  40.28 
 
 
322 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  39.8 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  39.86 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  40.94 
 
 
306 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  41.36 
 
 
309 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.49 
 
 
321 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.86 
 
 
277 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  37.36 
 
 
307 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  40.75 
 
 
295 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.78 
 
 
277 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  38.87 
 
 
293 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  37.93 
 
 
282 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  35.48 
 
 
283 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  37.68 
 
 
282 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
283 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  37 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  36.3 
 
 
306 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.61 
 
 
315 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  36.3 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  37.24 
 
 
282 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
283 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  36.95 
 
 
315 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  35.66 
 
 
303 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  37.25 
 
 
281 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  36.03 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
282 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
282 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
282 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  35.07 
 
 
292 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  35.37 
 
 
318 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  36.14 
 
 
304 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  35.23 
 
 
292 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  35.29 
 
 
277 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.45 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  36.52 
 
 
299 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  36.27 
 
 
315 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  35.62 
 
 
281 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  39.04 
 
 
323 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  35.29 
 
 
277 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.67 
 
 
278 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  36.36 
 
 
315 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  36.36 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  35.38 
 
 
282 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  34.81 
 
 
292 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  35.29 
 
 
291 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  34.81 
 
 
292 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  34.81 
 
 
292 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  34.81 
 
 
292 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
280 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  36.13 
 
 
315 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  35.25 
 
 
292 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.64 
 
 
282 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>