269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0213 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  80.07 
 
 		 300 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  80.27 
 
 		 301 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  79.73 
 
 		 300 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  78.93 
 
 		 301 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  66.67 
 
 		 298 aa  414  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  67.11 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  63.55 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  65.38 
 
 		 317 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  64.45 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  62.34 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  62.01 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  61.09 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  62.01 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  61.36 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  62.76 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  58.72 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  57.72 
 
 		 309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  58.78 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  59.72 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  56.94 
 
 		 316 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0752  taurine dioxygenase  54.73 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.29 
 
 		 305 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  55.75 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  54.74 
 
 		 301 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  54.67 
 
 		 308 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  52.3 
 
 		 381 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  52.6 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  50.17 
 
 		 295 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  53.5 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  52.28 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  52.28 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  52.28 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  51.89 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  49.13 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  51.21 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  51.08 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  48.21 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  48.28 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  49.65 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  47.24 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  45.07 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  43.11 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  41.42 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  40.06 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  39.71 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  38.99 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  39.24 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.99 
 
 		 277 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  39.56 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  40.14 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  38.26 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  39.71 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.99 
 
 		 291 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  36.56 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  38.19 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.58 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  37.74 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  39.35 
 
 		 277 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  37.42 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  38.46 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  37.74 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  38.8 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  39.04 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  37.42 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  37.37 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  37.01 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  37.01 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  38.49 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  37.15 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.01 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.67 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  36.81 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  36.81 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  36.81 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  36.81 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  36.81 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  36.81 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  38.43 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  39.7 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.89 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  35.23 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  39.33 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  36.95 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  35.02 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  35.02 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  35.02 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  36.52 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  36.69 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  34.25 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  36.55 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  35.14 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  36.01 
 
 		 282 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  35.71 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  35.84 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>