272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02787 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  43.38 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  43.38 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  43.38 
 
 		 283 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  43.38 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  43.38 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  43.38 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  43.38 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  43.01 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  43.75 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  41.61 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  41.33 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  40.29 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  41.33 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  41.7 
 
 		 277 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  42.75 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  43.12 
 
 		 277 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  41.26 
 
 		 282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  41.26 
 
 		 282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  41.76 
 
 		 280 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  41.26 
 
 		 282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  39.56 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  41.11 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.19 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  40.81 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  39.19 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  41.09 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  41.54 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  40.81 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  38.1 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  37.94 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  40.44 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  37.32 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  39.07 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.71 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  37.81 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  37.77 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  38.79 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  38.6 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  35.56 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  37.68 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  33.82 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  36.2 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  36.8 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  37.68 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  37.06 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21960  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA family  36.3 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  37.46 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  34.98 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  37.02 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  37.33 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  36.62 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.31 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  37.07 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.62 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  36.27 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  30.6 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  33.95 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  36.96 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  37.27 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  36.93 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  36.84 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  36.33 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  34.4 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  35.53 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  35.05 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  35.23 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  35.23 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  36.16 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  34.88 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  34.88 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  34.88 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  34.88 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  34.88 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  34.88 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  33.67 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  36.9 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  33.33 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1605  taurine dioxygenase  34.59 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.437386  normal  0.406612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  35.66 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.4 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2043  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  35.4 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2333  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  35.4 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1351  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  35.4 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  35.34 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1440  taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein  35.4 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  34.4 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  35.99 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3100  TauD/TfdA family dioxygenase  35.4 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1066  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  35.4 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  32.52 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  32.77 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  34.25 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  34.04 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.86 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  34.4 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  34.6 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  34.48 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>