275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21960  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA family  100 
 
 
317 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.162155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  42.86 
 
 
272 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  37.36 
 
 
285 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  40.15 
 
 
273 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  39.25 
 
 
283 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  38.72 
 
 
283 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  39.25 
 
 
283 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  38.98 
 
 
282 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  36.3 
 
 
314 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  33.22 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  37.86 
 
 
291 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.04 
 
 
295 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  35.4 
 
 
304 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.43 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.43 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  38.38 
 
 
277 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  36.9 
 
 
280 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  35.06 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.31 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  38.98 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  38.01 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  35.79 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  36.98 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  36.98 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  36.98 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.56 
 
 
271 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  34.31 
 
 
301 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  35.53 
 
 
278 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  34.06 
 
 
305 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  32.37 
 
 
297 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  34.67 
 
 
306 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  36.09 
 
 
282 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  34 
 
 
307 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  36.13 
 
 
289 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  32.84 
 
 
301 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  35.57 
 
 
277 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  35.43 
 
 
335 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  35.57 
 
 
277 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  34.69 
 
 
281 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  35.25 
 
 
277 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  33.33 
 
 
282 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  32.71 
 
 
323 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  31.44 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  31.82 
 
 
292 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  31.82 
 
 
292 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  31.82 
 
 
292 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  31.82 
 
 
292 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  35.14 
 
 
290 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  31.89 
 
 
280 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  31.82 
 
 
292 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  32.53 
 
 
289 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  33.21 
 
 
276 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  31.64 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  33.57 
 
 
322 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  31.93 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  33.93 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  31.44 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  31.21 
 
 
295 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  34.34 
 
 
282 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  31.69 
 
 
303 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  31.75 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
299 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  33.58 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.83 
 
 
305 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  31.34 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  33.45 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  31.1 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  30.04 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  32.65 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  30.4 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  32.3 
 
 
298 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.01 
 
 
282 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  30.69 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.97 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.94 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  32.57 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  32.27 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  30.77 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  32.41 
 
 
282 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  31.52 
 
 
298 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  31.56 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  30.45 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  31.1 
 
 
306 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  32.55 
 
 
308 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  32.55 
 
 
308 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  33.46 
 
 
282 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1586  taurine dioxygenase  30.69 
 
 
282 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  31.4 
 
 
304 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  29.1 
 
 
267 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  30.82 
 
 
282 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  30.32 
 
 
282 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  30.07 
 
 
316 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  30.11 
 
 
287 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>