265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28893 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28893  predicted protein  100 
 
 
412 aa  844    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30111  taurine catabolism dioxygenase  64.52 
 
 
414 aa  548  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51444  taurine catabolism dioxygenase  64.64 
 
 
424 aa  541  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.353625  normal  0.08977 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04111  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G01010)  62.22 
 
 
381 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  56.79 
 
 
388 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 
363 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02200  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_8G02210)  38.04 
 
 
383 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000205644  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34605  Fe(II)-dependent sulfonate/alpha-ketoglutarate dioxygenase-like protein  38.15 
 
 
385 aa  193  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11090  TfdA family taurine dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17170)  38.21 
 
 
372 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02960  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G07960)  38.34 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43041  predicted protein  36.22 
 
 
383 aa  189  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  36.68 
 
 
378 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08579  conserved hypothetical protein  41.11 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214725 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39554  alpha-ketoglutarate catabolism dioxygenase  35.38 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.470371 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01960  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
432 aa  179  7e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06800  taurine dioxygenase, putative  37.12 
 
 
376 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02500  conserved hypothetical protein  36.51 
 
 
338 aa  169  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  36.49 
 
 
281 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02198  conserved hypothetical protein  35.17 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.40403  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33987  predicted protein  35 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  38.69 
 
 
271 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29419  predicted protein  33.94 
 
 
420 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  34.93 
 
 
278 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06739  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_7G06030)  34.16 
 
 
376 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.303982  normal  0.0570192 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05350  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
375 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  34.75 
 
 
270 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03570  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 
368 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  34.69 
 
 
283 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  34.69 
 
 
283 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  34.71 
 
 
283 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
280 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
335 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  35.58 
 
 
285 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  33.9 
 
 
282 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
277 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  32.99 
 
 
277 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
277 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  35.12 
 
 
282 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  34.75 
 
 
295 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  34.16 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  33.22 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  35.31 
 
 
289 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  34.01 
 
 
318 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  34.15 
 
 
312 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  36.1 
 
 
290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  33 
 
 
277 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  33.56 
 
 
292 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  35.46 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  34.02 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  30.93 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  32.88 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  32.54 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  31.27 
 
 
277 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  32.31 
 
 
282 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  32.31 
 
 
282 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  32.31 
 
 
282 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
277 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  32.49 
 
 
276 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  34.02 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  30.9 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  33.71 
 
 
272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  33.22 
 
 
308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3086  taurine dioxygenase  33.95 
 
 
290 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.042255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  31.72 
 
 
315 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
264 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  32.12 
 
 
309 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
264 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.14 
 
 
305 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  29.84 
 
 
293 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  35.61 
 
 
304 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
315 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  31.62 
 
 
315 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  32.42 
 
 
304 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.01 
 
 
315 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.21 
 
 
321 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  31.1 
 
 
280 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  33.8 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  32.61 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  31.99 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  31.18 
 
 
308 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  29.35 
 
 
299 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  32.78 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
315 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
315 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  31.09 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>