272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29419 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29419  predicted protein  100 
 
 
420 aa  862    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106431 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33987  predicted protein  76.78 
 
 
432 aa  667    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43041  predicted protein  43.02 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  42.37 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39554  alpha-ketoglutarate catabolism dioxygenase  40.94 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.470371 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34605  Fe(II)-dependent sulfonate/alpha-ketoglutarate dioxygenase-like protein  42.69 
 
 
385 aa  239  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  40.78 
 
 
363 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02200  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_8G02210)  39.06 
 
 
383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000205644  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02960  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G07960)  40 
 
 
384 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06739  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_7G06030)  34.69 
 
 
376 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.303982  normal  0.0570192 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08579  conserved hypothetical protein  38.97 
 
 
429 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214725 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51444  taurine catabolism dioxygenase  34.23 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.353625  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  33.23 
 
 
388 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30111  taurine catabolism dioxygenase  32.47 
 
 
414 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28893  predicted protein  33.94 
 
 
412 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.284292 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11090  TfdA family taurine dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17170)  29.71 
 
 
372 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01960  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
432 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05350  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04111  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G01010)  30.95 
 
 
381 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02198  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.40403  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  33.68 
 
 
277 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  32.99 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  31.76 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  32.59 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  31.83 
 
 
285 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.38 
 
 
270 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06800  taurine dioxygenase, putative  29.5 
 
 
376 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  33.11 
 
 
303 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  31.67 
 
 
283 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  31.67 
 
 
283 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  33 
 
 
278 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  32.21 
 
 
277 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  31.67 
 
 
283 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  30.82 
 
 
277 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  31.33 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  31.33 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  31.33 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  31.33 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  31.33 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  31.88 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  30.85 
 
 
304 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.89 
 
 
305 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  32.87 
 
 
322 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03570  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  32.27 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  29.43 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  30.48 
 
 
277 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  30.85 
 
 
297 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  30.94 
 
 
271 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  30.87 
 
 
277 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  29.59 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  29.59 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  29.59 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  29.45 
 
 
277 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  29.9 
 
 
291 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  33.8 
 
 
293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  29.24 
 
 
283 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  32.55 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  31.8 
 
 
289 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  31.86 
 
 
305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  30.13 
 
 
292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  29.8 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  29.8 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  29.8 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  29.8 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  29.8 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  30.1 
 
 
306 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  32.09 
 
 
282 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  32.06 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  29.8 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  32.55 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  33.1 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.13 
 
 
315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  31.88 
 
 
304 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  32.06 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  30.77 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  30.8 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  30.94 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  32.34 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00215  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 
352 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360325  normal  0.47594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  29.51 
 
 
293 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  30.98 
 
 
292 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
316 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  29.49 
 
 
301 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  30.62 
 
 
315 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  30.74 
 
 
295 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  31.4 
 
 
300 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  31.46 
 
 
300 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  30.29 
 
 
315 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  30.29 
 
 
315 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  30.23 
 
 
295 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  29.73 
 
 
281 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  30.92 
 
 
307 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  30.3 
 
 
307 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  32.64 
 
 
299 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  30.51 
 
 
267 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  29.35 
 
 
327 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  30.54 
 
 
301 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  29.35 
 
 
327 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>