272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34605 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_34605  Fe(II)-dependent sulfonate/alpha-ketoglutarate dioxygenase-like protein  100 
 
 
385 aa  793    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39554  alpha-ketoglutarate catabolism dioxygenase  81.51 
 
 
386 aa  655    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.470371 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43041  predicted protein  65.86 
 
 
383 aa  505  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  63.54 
 
 
378 aa  476  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02960  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G07960)  55.25 
 
 
384 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02200  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_8G02210)  54.19 
 
 
383 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000205644  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  46.34 
 
 
363 aa  292  8e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08579  conserved hypothetical protein  49.66 
 
 
429 aa  289  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214725 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06739  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_7G06030)  43.92 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.303982  normal  0.0570192 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33987  predicted protein  43.91 
 
 
432 aa  269  7e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29419  predicted protein  42.69 
 
 
420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106431 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01960  conserved hypothetical protein  41.76 
 
 
432 aa  230  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05350  conserved hypothetical protein  36.18 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28893  predicted protein  38.15 
 
 
412 aa  203  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30111  taurine catabolism dioxygenase  41.21 
 
 
414 aa  202  9e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  38.54 
 
 
388 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04111  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G01010)  36.71 
 
 
381 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51444  taurine catabolism dioxygenase  37.88 
 
 
424 aa  182  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.353625  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06800  taurine dioxygenase, putative  35.54 
 
 
376 aa  169  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  35 
 
 
289 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.54 
 
 
271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.51 
 
 
285 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11090  TfdA family taurine dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17170)  28.57 
 
 
372 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  32.78 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  33.68 
 
 
297 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  31.19 
 
 
304 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  32.64 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  31.48 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  31.48 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  31.48 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  31.48 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  31.48 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  31.48 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  32.99 
 
 
282 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  32.23 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  31.48 
 
 
283 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  31.11 
 
 
283 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  34.4 
 
 
270 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  31.71 
 
 
278 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  32.22 
 
 
277 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  31 
 
 
280 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  33.1 
 
 
301 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  33.92 
 
 
318 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  34.44 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  33.22 
 
 
295 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03570  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 
368 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  32.76 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  32.76 
 
 
277 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
277 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  31 
 
 
283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02500  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  31.72 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  30.4 
 
 
277 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  29.86 
 
 
291 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  32.71 
 
 
293 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  31.06 
 
 
282 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  31.06 
 
 
282 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  31.06 
 
 
282 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  33.46 
 
 
312 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  32.05 
 
 
281 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  34.49 
 
 
304 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  31.16 
 
 
295 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.12 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  32.86 
 
 
282 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  32.45 
 
 
299 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  31.12 
 
 
315 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  31.82 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  30.74 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.12 
 
 
315 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  28.89 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  30.77 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02198  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.40403  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  31.58 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  29.21 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  31.36 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  31.18 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  29.12 
 
 
281 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  29.45 
 
 
301 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  31 
 
 
287 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
267 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  29.86 
 
 
303 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  31.21 
 
 
280 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.53 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  30 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  34.04 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  29.12 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  33.2 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4724  taurine dioxygenase  29.43 
 
 
276 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  28.84 
 
 
276 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  30.25 
 
 
282 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>